石门子水源建于1956年，位于玉门老区东南白杨河中上游河谷中，因其附近有上部几平合拢、下部水流而过形状似门的石峡而得名。
石门子水源包括取水口、冬季渗水渠、输水管线等设施。夏季，将闸板立于狭窄的河床，借助天然地形，形成简易河坝蓄水使泥沙下沉，上层清水经滤网流入取水口，进入水管线，利用高差自流至石油沟。冬季，河水流经渗水渠，上层结冰形成暗流，渗入渗水道流入汇水井，进入输水管线自流至石油沟。
1956年，随着石油沟油田的持续钻探发现和加快开发，为解决石油沟油田生产生活用水问题，玉门油田组织建设石门子水源。主要设施有起始点与终点高差64米的输水管线8949米、沿途设置13个泄水闸门和1个放空闸门，负责向石油沟油矿供水，设计供水能力为每日50立方米。
1967年，为保证工业用水质量，进行石油沟水渠水质净化工程，修建二孔闸、工作桥，新建拦河坝20米、弯道沉砂池1座、值班房1间，有效地控制水位。从1970年开始，为满足注水开发的需要，对石门子水源进行多次改造和扩建。
1976年，对石门子水源进行改造，主要措施是提高水位、增加供水压力，调整改造供水管线等。1977年，换装石门子红山口至石油沟转水站供水管线3千米。1978年，随着白杨河油田的持续勘探和全面开发，玉门油田决定对石门子水源进行扩建，新建10米拦洪坝1条，排沙排洪闸门1个，直径200毫米、长度6700米的输水管线1条，满足白杨河油矿生产生活用水，扩建后供水能力提高到每日3000立方米，最大供水量可达每日4000立方米。
1990年新修长180米、宽8米渗水道一条，其主要设施有长10米的拦洪坝1条，排洪排沙闸1个，管径219毫米输水管线1条，全长7．80千米。
2015年4月，原水源存在蓄水输水设施陈旧、山势地形限制巡检排沙难度大、岗位偏僻、生产安全风险大等诸多不利因素，对石门子水源取水设施改造刻不容缓。无人值守泵房投运后，仅利用了红山梁至石油沟水池的老管线输水，其他设备设施全部停用废弃。几年来，设备运行平稳，安全可靠。
60多年来，石门子水源一直承担石油沟油田和白杨河油田供水重任，整体风貌保存完好。