据巴西农业部的统计数据，巴西全国有8．5亿公顷土地，其中4．44亿公顷可用于农业生产，而目前甘蔗和大豆的种植面积只占可耕地的约5％左右，巴西生物燃料的发展前景巨大。近年来，巴西政府也把发展生物燃料（主要包括生物乙醇和生物柴油）作为科技创新优先发展领域，将其作为解决能源问题的一条重要途径。
生物燃料在巴西并不是一个新生的事物。它最早可以追溯到上世纪70年代。
20世纪70年代以前，由于当时巴西探明的原油储量不足，巴西基本上依赖石油进口。在经历过1973年和1975年两次石油危机之后，巴西政府开始积极探索可再生能源的开发利用。由于巴西气候和地理环境非常适合种植甘蔗，在1975年巴西宣布实施国家乙醇计划，鼓励利用甘蔗生产乙醇以替代石油，启动了一系列鼓励刺激措施，拉开了发展甘蔗乙醇的序幕。巴西也因此成为世界上开展生物燃料研究最早的国家之一，能利用甘蔗、木薯及工农业废渣大规模生产乙醇，并开发出了用棕榈油提炼柴油的技术。
从1986年开始，在油价稳定和糖价暴涨及政府更迭等因素的影响下，巴西的甘蔗加工厂抛弃提炼乙醇转为直接生产蔗糖，导致乙醇产量急剧萎缩，加油站的乙醇供应也随之断档，巴西燃料乙醇的发展遭受了重大打击。不过，好在巴西的科学家们在那对燃料乙醇无人问津的年代还是一如既往地致力于提高燃料乙醇生产效率的研究。
进入21世纪后，巴西乙醇的生产效率翻了3番，生产成本也下降至0．2美元左右，加之同期国际油价持续走高，乙醇燃料在巴西的再度推广在经济上又变得可行。
随着国内市场日益饱和，扩大出口成为巴西进一步发展乙醇计划的重要一环。为主导乙醇国际市场、扩大巴西在能源领域的影响力，巴西与美国合作设立了美洲乙醇委员会，银行、美洲机构等奖励在中美及加勒比海地区使用乙醇。巴西与日本国际合作银行达成协议，计划引资13亿美元，用于乙醇生产技术的开发及工厂的设立。与此同时，巴西政府对乙醇产业建立了认证制度，通过设定严格的生物燃料标准以确保燃料乙醇和生物柴油在市场上的规范化使用。
新兴的可再生航空燃料技术有望较大幅度减少温室气体的排放，自2011年生物燃料开始使用以来，全球已经有超过1500次飞行使用了生物燃料。在整个寿命周期内，生物燃料消耗可比传统石化燃油降低50％～80％。
在这方面，巴西甘蔗中的乙醇就是一个很好的例证。2011年，巴西航空工业公司（EmbraerS．A．）、波音公司（BoeingCo．）及中美洲开发银行（IBD）共同宣布，将共同提供资金，支持对生产取自巴西甘蔗的可再生航空燃料的可持续性进行分析。该项研究内容包括，对阿米瑞斯公司可再生航空燃料的排放物进行完整的生命周期分析，内容涵盖对土地用途的间接改变及其影响。气候变化正威胁着生物的多样性及世界上部分最具代表性物种的重要栖息地，伴随可再生航空燃料产量的增加，其生产必须透明和可持续化。作为不断壮大的国际航空减排队伍的一员，世界野生动物基金会（WWF）希望能够为减缓迅速增长的航空排放物做出贡献，保护人类赖以生存的关键性资源。世界野生动物基金会将是此次可持续性分析工作的独立评论方及顾问。
2014年5月，美国波音和巴西EMBRAER公司表示，两家公司将共同投资，并联合巴西大学和其它研究机构，继续推进巴西的航空替代生物燃料研究。这将使两家公司形成协同，在巴西建立成熟可靠的替代燃料工业。9月，巴西生物燃料公司GranBio宣布，实现了以甘蔗纤维素为原料大规模生产第二代乙醇燃料，成为拉美第一家实现二代乙醇商业化生产的科技公司。
目前，巴西是以甘蔗为原料的燃料乙醇第一出口大国和出口国，同时也是仅次于美国的第二大生物燃料生产国，在基础研究和产业开发方面取得的成绩越来越受到世界瞩目。巴西有100多家专门生产乙醇的工厂，国内加油站提供100％燃料乙醇，是世界上唯一在全国范围内不供应纯汽油的国家。
在突破了一系列的技术难题之后，巴西生物燃料的前途似乎一片光明。可就在2014年，一直被认为水资源充沛的巴西面临着自1930年以来最严峻的干旱困扰，干旱导致的水资源短缺造成西东南部及东北部大部分城市的农田无法灌溉、电力短缺等，影响到4580万巴西人。这不仅严重危及巴西经济的发展，也对生物燃料的进一步发展构成威胁。
大面积的干旱影响的多为圣保罗、米纳斯等农业大州，严重影响到巴西的蔗糖、咖啡等的生产，使原本就受到“人车争粮”争议的生物燃料的农作物来源堪忧。巴西科学院水资源研究的协调员何塞表示，如果这一情况继续持续，巴西经济将会受到严重影响。这当然也包括生物燃料在内。
纵观历史，巴西分别在1930年，1959年和1976年左右都遭遇过类似状况，而从2012年起巴西的降雨量就一直处于较低水平。在2012年，尽管巴西粮食播种面积比2011年增加了4％，但由于南部各州遭遇了严重干旱，粮食总产量比2011年减少了0．7％。联合国粮农组织总干事格拉齐亚诺也表示，巴西全国所有的作物产量都受到了巨大影响，即使是对雨水要求不是很高的甘蔗也承受不住2014年的大旱。
相比以往，这一状况可能持续的时间要长一些。有分析人士指出，这一较低的降雨量或将持续到2020年左右，巴西政府需要做长远打算，另外还要加大粮食库存，并优先抗旱作物的种植。
巴西持续的干旱无疑将使各种农产品价格上涨，届时巴西的生物燃料也可能会面临“无米下锅”的窘境。